Dysbioza wirusowa u dzieci z nowo rozpoznaną celiakią
Wirusy są powszechnymi składnikami mikrobiomu jelitowego, modulującymi metabolizm bakterii gospodarza i oddziałującymi z układem odpornościowym, odgrywając możliwą rolę w patogenezie chorób o podłożu immunologicznym, takich jak celiakia (CeD). Celem tego badania była charakterystyka profilu wiromu u dzieci z nowo rozpoznanym CeD. Wykorzystaliśmy analizę metagenomiczną DNA wirusa w próbkach śluzówki i kału od dzieci z CeD i kontrolami oraz przeprowadziliśmy sekwencjonowanie przy użyciu zestawu do przygotowania biblioteki Nextera XT . Obfitość log2-krotnych zmian obliczono stosując ekspresję różnicową i liniową wielkość efektu dyskryminacyjnego. Określono zróżnicowanie Shannona alfa i Bray-Curtis beta. Łącznie włączono 40 dzieci z CeD i 39 osób z grupy kontrolnej.
Znaleźliśmy wirusową dysbiozę zarówno w próbkach kału, jak i śluzówki. Przykłady znacznie liczniejszych gatunków w próbkach kału dzieci z CeD obejmowały ludzki poliomawirus 2, fag Enterobacteria mEpX1 i fag Enterobacteria mEpX2; podczas gdy gatunki mniej liczne obejmowały fagi Lactococcus ul36 i fagi Streptococcus Abc2.
Jednak w próbkach śluzówki żaden gatunek nie był istotnie związany z CeD. Różnorodność Shannona alfa nie różniła się istotnie między grupami z CeD i bez CeD, a różnorodność Bray-Curtis beta nie wykazała istotnego rozdziału między próbkami z CeD i bez CeD w próbkach śluzówki lub kału, podczas gdy separacja była wyraźna we wszystkich próbkach. Zidentyfikowaliśmy istotną dysbiozę wirusową u dzieci z CeD, co sugeruje potencjalną rolę w patogenezie CeD, co wskazuje na potrzebę dalszych badań.
Dimeryczny peptyd zasiedlający nowe naczynia nowotworowe GX1 wykazuje działanie antyangiogenne w nowych naczyniach siatkówki
Identyfikacja cząsteczek swoistych dla neounaczynienia siatkówki będzie promować terapię antyangiogenną o zwiększonej zdolności celowania. Swoistość prezentowanego na fagach peptydu GX1 (cykliczny 7-merowy motyw peptydowy CGNSNPKSC) wobec nowych naczyń krwionośnych raka żołądka została szeroko potwierdzona zarówno in vitro, jak i in vivo. Aby zbadać potencjalne zastosowanie GX1 w terapii antyangiogennej ukierunkowanej na choroby związane z angiogenezą siatkówki, przeprowadziliśmy analizy immunohistochemiczne i immunofluorescencyjne.
- GX1 wykazał dodatnie barwienie w neounaczynieniu siatkówki w mysim modelu retinopatii wywołanej tlenem (OIR), jak również w szczurzych komórkach śródbłonka mikronaczyń siatkówki (RMEC), potwierdzając główną rolę receptora GX1 podczas angiogenezy siatkówki.
- Zsyntetyzowano dimeryczny GX1 w celu zwiększenia powinowactwa wiązania do receptora GX1, a efekty antyangiogenne zbadano w RMEC in vitro oraz w neowaskularyzacji siatkówki w OIR in vivo.
- Proliferację komórek oceniano za pomocą testu Cell Counting Kit -8 (CCK-8), ujawniając, że w porównaniu z monomerem GX1, dimeryczny GX1 znacząco hamował proliferację RMEC (P < 0,05).
- Odkrycie to można przypisać zwiększonej (P < 0,05) apoptozie indukowanej przez dimeryczną GX1 w RMEC na podstawie wyników uzyskanych z TUNEL, cytometrii przepływowej i analizy cyklu komórkowego.
- W RMEC, migracja komórek in vitro i tworzenie rurek były znacząco hamowane po ekspozycji na dimeryczną GX1. Podawanie do ciała szklistego dimerycznej GX1 skutkowało większym zmniejszeniem neowaskularyzacji siatkówkowej in vivo niż podanie monomeru GX1 (P < 0,05).
- Podsumowując, dimeryczna GX1 wykazywała silniejsze hamowanie angiogenezy niż monomeryczna GX1 i mogłaby być obiecującym środkiem w terapii antyangiogennej w chorobach związanych z angiogenezą siatkówki.
Badanie fagowe przeciwciał bydlęcych przeciwko wirusowi pryszczycy i ich zastosowanie w konkurencyjnym teście ELISA do serodiagnostyki
Do serodiagnostyki wirusa pryszczycy (FMDV) powszechnie stosuje się kompetycyjny test ELISA (cELISA) oparty na przeciwciałach monoklonalnych (MAb), ponieważ umożliwia proste i powtarzalne wykrywanie odpowiedzi przeciwciał na FMDV. Jednak zastosowanie MAb pochodzenia mysiego jako odczynnika wykrywającego jest wątpliwe, ponieważ odpowiedzi przeciwciał na FMDV u myszy mogą różnić się strukturą epitopu i preferencjami od odpowiedzi u naturalnych gospodarzy, takich jak bydło i świnie. Aby wykorzystać naturalne przeciwciała pochodzące od gospodarza, skonstruowano prezentowaną na fagach bibliotekę scFv z bydła opornego na FMDV i poddano dwóm oddzielnym panningom przeciwko inaktywowanym FMDV typu O i A. Późniejsze badania przesiewowe ELISA ujawniły przeciwciała scFv o wysokim powinowactwie specyficzne dla serotypu (O lub A), jak również te o swoistości panserotypowej.
Kiedy BvO17, przeciwciało scFv specyficzne dla FMDV typu O, zostało przetestowane jako odczynnik wykrywający w cELISA, z powodzeniem wykryło przeciwciała FMDV typu O zarówno w próbkach surowicy od zaszczepionego bydła, jak i świń zakażonych wirusem, z jeszcze wyższą czułością niż mysie przeciwciała MAb oparte na MAb komercyjny zestaw do wykrywania przeciwciał FMDV typu O . Wyniki te pokazują wykonalność zastosowania naturalnych przeciwciał pochodzących od gospodarza, takich jak bydlęce scFv zamiast mysiego MAb w cELISA do serologicznego wykrywania odpowiedzi przeciwciał na FMDV u podatnych zwierząt.
Symetryczny czterowartościowy łącznik NATBA swoisty dla sulfhydrylu ułatwia kombinatoryczną strategię „ zestawu narzędzi” do selekcji funkcjonalizowanych bicyklicznych peptydów na podstawie prezentacji fagowej
Sztywna konformacja ograniczonych bicyklicznych peptydów zapewnia szereg korzyści w porównaniu z większymi ligandami opartymi na białkach, w tym lepszą stabilność chemiczną, zwiększoną penetrację tkanek i szerszy zakres możliwych zastosowań. Strategie selektywnej modyfikacji chemicznej są w stanie rozszerzyć zakres zastosowań nie tylko w sposób terapeutyczny, ale także w celu opracowania nowych narzędzi do wychwytywania białek, bioobrazowania i celowanego dostarczania leków.
W niniejszym dokumencie opisujemy syntezę opartego na adamantanie, symetrycznego, czterowartościowego, specyficznego dla sulfhydrylu łącznika peptydowego. Opracowaliśmy dwuetapową strategię modyfikacji in vitro, która umożliwia generowanie różnie funkcjonalizowanych bicyklicznych peptydów. Ta strategia „zestawu narzędzi” została zastosowana do cyklizacji i funkcjonalizacji biblioteki peptydów kodowanych przez fagi mające sekwencję CX6CX6C. Po prezentacji fagowej przeciwko modelowemu celowi, wyizolowane peptydy wykazują silne sekwencje konsensusowe, co wskazuje na wiązanie specyficzne wobec celu. Nowo opracowany symetryczny łącznik czterowartościowy otwiera nowe możliwości kombinatorycznej selekcji i funkcjonalizacji bicyklicznych ligandów peptydowych o powinowactwie do praktycznie każdego celu.
Walidacja zestawu do typowania fagów z otwartą ramką odczytu do szybkiej identyfikacji opornego na metycylinę gronkowca złocistego (MRSA) w szpitalu trzeciego stopnia
Nadzór jest bardzo ważny, aby zapobiec szpitalnemu rozprzestrzenianiu się gronkowca złocistego opornego na metycylinę (MRSA), a źródła i drogi zakażenia były historycznie identyfikowane za pomocą molekularnego i epidemiologicznego genotypowania z elektroforezą żelową w polu pulsacyjnym. Jednak ostatnio opracowano fago-otwartą ramkę odczytu (POT). Tutaj zbadaliśmy, czy POT byłby przydatny do badania epidemii i transmisji MRSA. Dlatego zastosowaliśmy POT do 91 izolatów MRSA wykrytych w hodowlach od pacjentów hospitalizowanych w naszym szpitalu od maja do października 2014 roku.
Fagomine |
|||
| HY-13005 | MedChemExpress | 10mM/1mL | 424.8 EUR |
Rat F5-Ag ELISA Kit |
|||
| ERF0045 | Abclonal | 96Tests | 625.2 EUR |
Goat F5-Ag ELISA Kit |
|||
| EGTF0045 | Abclonal | 96Tests | 625.2 EUR |
Mouse F5-Ag ELISA Kit |
|||
| EMF0045 | Abclonal | 96Tests | 625.2 EUR |
Sheep F5-Ag ELISA Kit |
|||
| ESF0045 | Abclonal | 96Tests | 625.2 EUR |
Human F5-Ag ELISA Kit |
|||
| EHF0045 | Abclonal | 96Tests | 625.2 EUR |
Monkey F5-Ag ELISA Kit |
|||
| EMKF0045 | Abclonal | 96Tests | 625.2 EUR |
Rabbit F5-Ag ELISA Kit |
|||
| ERTF0045 | Abclonal | 96Tests | 625.2 EUR |
Bovine F5-Ag ELISA Kit |
|||
| EBF0045 | Abclonal | 96Tests | 625.2 EUR |
Canine F5-Ag ELISA Kit |
|||
| ECF0045 | Abclonal | 96Tests | 625.2 EUR |
Porcine F5-Ag ELISA Kit |
|||
| EPF0045 | Abclonal | 96Tests | 625.2 EUR |
Chicken F5-Ag ELISA Kit |
|||
| ECKF0045 | Abclonal | 96Tests | 625.2 EUR |
Anserini F5-Ag ELISA Kit |
|||
| EAF0045 | Abclonal | 96Tests | 625.2 EUR |
Guinea Pig F5-Ag ELISA Kit |
|||
| EGF0045 | Abclonal | 96Tests | 625.2 EUR |
FA-Gly-OH |
|||
| M-1360.0001 | Bachem | 1.0g | 151.2 EUR |
FA-Gly-OH |
|||
| M-1360.0005 | Bachem | 5.0g | 501.6 EUR |
FA-Glu-Glu-OH |
|||
| M-2385.0050 | Bachem | 50.0mg | 691.2 EUR |
FA-Glu-Glu-OH |
|||
| M-2385.0250 | Bachem | 250.0mg | 2648.4 EUR |
FA-Gly-Leu-OH |
|||
| M-1370.0250 | Bachem | 250.0mg | 559.2 EUR |
FA-Gly-Leu-OH |
|||
| M-1370.1000 | Bachem | 1.0g | 1603.2 EUR |
Fagaronine |
|||
| TBW00159 | ChemNorm | unit | Ask for price |
FA-Gly-Phe-NH2 |
|||
| M-1770.0250 | Bachem | 250.0mg | 529.2 EUR |
FA-Gly-Phe-NH2 |
|||
| M-1770.1000 | Bachem | 1.0g | 1516.8 EUR |
FA-Gly-Val-NH2 |
|||
| M-1820.0050 | Bachem | 50.0mg | 356.4 EUR |
FA-Gly-Val-NH2 |
|||
| M-1820.0250 | Bachem | 250.0mg | 1311.6 EUR |
FA-Gly-Nva-NH2 |
|||
| M-1830.0050 | Bachem | 50.0mg | 691.2 EUR |
FA-Gly-Nva-NH2 |
|||
| M-1830.0250 | Bachem | 250.0mg | 2648.4 EUR |
FA-Gly-Abu-NH2 |
|||
| M-1835.0050 | Bachem | 50.0mg | 691.2 EUR |
FA-Gly-Abu-NH2 |
|||
| M-1835.0250 | Bachem | 250.0mg | 2648.4 EUR |
FA-Gly-Leu-NH2 |
|||
| M-1375.0250 | Bachem | 250.0mg | 327.6 EUR |
FA-Gly-Leu-NH2 |
|||
| M-1375.1000 | Bachem | 1.0g | 907.2 EUR |
Sesamin(Fagarol) |
|||
| E1KS2392 | EnoGene | 5mg | 404.4 EUR |
Fagilis Antibody |
|||
| abx026313-400ul | Abbexa | 400 ul | 627.6 EUR |
Fagilis Antibody |
|||
| abx026313-80l | Abbexa | 80 µl | 343.2 EUR |
FA-Gly-Leu-Ala-OH |
|||
| M-1800.0050 | Bachem | 50.0mg | 356.4 EUR |
FA-Gly-Leu-Ala-OH |
|||
| M-1800.0250 | Bachem | 250.0mg | 1311.6 EUR |
FA-Gly-Phe-Leu-OH |
|||
| M-1845.0050 | Bachem | 50.0mg | 297.6 EUR |
FA-Gly-Phe-Leu-OH |
|||
| M-1845.0250 | Bachem | 250.0mg | 1082.4 EUR |
Recombinant human FA83G |
|||
| P2071 | FN Test | 100ug | Ask for price |
Protein FAM83G (FA83G) Antibody |
|||
| abx027665-400ul | Abbexa | 400 ul | 627.6 EUR |
Protein FAM83G (FA83G) Antibody |
|||
| abx027665-80l | Abbexa | 80 µl | 343.2 EUR |
Polyclonal Fagilis (IFITM3) Antibody (Center) |
|||
| APR14334G | Leading Biology | 0.1ml | 580.8 EUR |
Human Kit ELISA Kit |
|||
| ELA-E0121h | Lifescience Market | 96 Tests | 988.8 EUR |
Human KIT/SCFR ELISA kit |
|||
| LF-EK50791 | Abfrontier | 1×96T | 777.6 EUR |
KIT ELISA Kit (Dog) (OKEH07316) |
|||
| OKEH07316 | Aviva Systems Biology | 96 Wells | 1420.8 EUR |
KIT ELISA Kit (Pig) (OKEH07317) |
|||
| OKEH07317 | Aviva Systems Biology | 96 Wells | 1310.4 EUR |
Gas Changeover Kit PC30 Kit |
|||
| GAS1105 | Scientific Laboratory Supplies | EACH | 1569.33 EUR |
Kit ELISA Kit (Mouse) (OKBB01105) |
|||
| OKBB01105 | Aviva Systems Biology | 96 Wells | 606 EUR |
KIT ELISA Kit (Human) (OKAN04574) |
|||
| OKAN04574 | Aviva Systems Biology | 96 Wells | 950.4 EUR |
KIT ELISA Kit (Human) (OKCD06003) |
|||
| OKCD06003 | Aviva Systems Biology | 96 Wells | 777.6 EUR |
KIT ELISA Kit (Mouse) (OKCD06004) |
|||
| OKCD06004 | Aviva Systems Biology | 96 Wells | 934.8 EUR |
KIT ELISA Kit (Bovine) (OKEH07314) |
|||
| OKEH07314 | Aviva Systems Biology | 96 Wells | 1310.4 EUR |
ELISA kit for Pregnenolone Kit |
|||
| E-EL-0086 | Elabscience Biotech | 1 plate of 96 wells | 452.4 EUR |
KIT ELISA Kit (Chicken) (OKEH07315) |
|||
| OKEH07315 | Aviva Systems Biology | 96 Wells | 1420.8 EUR |
Cow Kit ligand (KITLG) ELISA Kit |
|||
| abx511856-96tests | Abbexa | 96 tests | 1093.2 EUR |
Dog Kit ligand (KITLG) ELISA Kit |
|||
| abx511858-96tests | Abbexa | 96 tests | 1093.2 EUR |
Pig Kit ligand (KITLG) ELISA Kit |
|||
| abx511861-96tests | Abbexa | 96 tests | 1093.2 EUR |
Rat Kit ligand (KITLG) ELISA Kit |
|||
| abx511862-96tests | Abbexa | 96 tests | 801.6 EUR |
Rat Kit Ligand, Kitlg ELISA Kit |
|||
| DEIA142 | Creative Diagnostics | 10 plates | 2994 EUR |
Dog Kit ligand(KITLG) ELISA kit |
|||
| E08K0089-192T | BlueGene | 192 tests | 1524 EUR |
Dog Kit ligand(KITLG) ELISA kit |
|||
| E08K0089-48 | BlueGene | 1 plate of 48 wells | 624 EUR |
Dog Kit ligand(KITLG) ELISA kit |
|||
| E08K0089-96 | BlueGene | 1 plate of 96 wells | 822 EUR |
Rat Kitlg/ Kit ligand ELISA Kit |
|||
| E0545Ra | Sunlong | 1 Kit | 655.2 EUR |
Rat Kit ligand(KITLG) ELISA kit |
|||
| E02K0089-192T | BlueGene | 192 tests | 1524 EUR |
Rat Kit ligand(KITLG) ELISA kit |
|||
| E02K0089-48 | BlueGene | 1 plate of 48 wells | 624 EUR |
Rat Kit ligand(KITLG) ELISA kit |
|||
| E02K0089-96 | BlueGene | 1 plate of 96 wells | 822 EUR |
Pig Kit ligand(KITLG) ELISA kit |
|||
| E07K0089-192T | BlueGene | 192 tests | 1524 EUR |
Pig Kit ligand(KITLG) ELISA kit |
|||
| E07K0089-48 | BlueGene | 1 plate of 48 wells | 624 EUR |
Pig Kit ligand(KITLG) ELISA kit |
|||
| E07K0089-96 | BlueGene | 1 plate of 96 wells | 822 EUR |
Mouse Kit Ligand, Kitl ELISA Kit |
|||
| DEIA140 | Creative Diagnostics | 10 plates | 2994 EUR |
Goat Kit ligand(KITLG) ELISA kit |
|||
| E06K0089-192T | BlueGene | 192 tests | 1524 EUR |
Goat Kit ligand(KITLG) ELISA kit |
|||
| E06K0089-48 | BlueGene | 1 plate of 48 wells | 624 EUR |
Goat Kit ligand(KITLG) ELISA kit |
|||
| E06K0089-96 | BlueGene | 1 plate of 96 wells | 822 EUR |
Human Kit ligand (KITLG) ELISA Kit |
|||
| abx253483-96tests | Abbexa | 96 tests | 801.6 EUR |
Mouse Kit ligand (KITLG) ELISA Kit |
|||
| abx511860-96tests | Abbexa | 96 tests | 801.6 EUR |
Human Kit Ligand, KitLG ELISA Kit |
|||
| DEIA141 | Creative Diagnostics | 10 plates | 2994 EUR |
Mouse Kit ligand(KITLG) ELISA kit |
|||
| E03K0089-192T | BlueGene | 192 tests | 1524 EUR |
Mouse Kit ligand(KITLG) ELISA kit |
|||
| E03K0089-48 | BlueGene | 1 plate of 48 wells | 624 EUR |
Mouse Kit ligand(KITLG) ELISA kit |
|||
| E03K0089-96 | BlueGene | 1 plate of 96 wells | 822 EUR |
Human Kit ligand(KITLG) ELISA kit |
|||
| E01K0089-192T | BlueGene | 192 tests | 1524 EUR |
Human Kit ligand(KITLG) ELISA kit |
|||
| E01K0089-48 | BlueGene | 1 plate of 48 wells | 624 EUR |
Human Kit ligand(KITLG) ELISA kit |
|||
| E01K0089-96 | BlueGene | 1 plate of 96 wells | 822 EUR |
Human KITLG/ Kit ligand ELISA Kit |
|||
| E1378Hu | Sunlong | 1 Kit | 644.4 EUR |
Mouse Kitlg/ Kit ligand ELISA Kit |
|||
| E1654Mo | Sunlong | 1 Kit | 655.2 EUR |
Human KITLG(Kit ligand ) ELISA Kit |
|||
| EH0514 | FN Test | 96T | 628.92 EUR |
Rabbit Kit ligand(KITLG) ELISA kit |
|||
| E04K0089-192T | BlueGene | 192 tests | 1524 EUR |
Rabbit Kit ligand(KITLG) ELISA kit |
|||
| E04K0089-48 | BlueGene | 1 plate of 48 wells | 624 EUR |
Rabbit Kit ligand(KITLG) ELISA kit |
|||
| E04K0089-96 | BlueGene | 1 plate of 96 wells | 822 EUR |
Bovine KITLG/ Kit ligand ELISA Kit |
|||
| E0164Bo | Sunlong | 1 Kit | 860.4 EUR |
Monkey Kit ligand(KITLG) ELISA kit |
|||
| E09K0089-192T | BlueGene | 192 tests | 1524 EUR |
Monkey Kit ligand(KITLG) ELISA kit |
|||
| E09K0089-48 | BlueGene | 1 plate of 48 wells | 624 EUR |
Monkey Kit ligand(KITLG) ELISA kit |
|||
| E09K0089-96 | BlueGene | 1 plate of 96 wells | 822 EUR |
Chicken Kit ligand (KITLG) ELISA Kit |
|||
| abx511857-96tests | Abbexa | 96 tests | 1093.2 EUR |
Rat ANG1-9Â Kit ELISA kit |
|||
| E02A0231-192T | BlueGene | 192 tests | 1524 EUR |
Rat ANG1-9Â Kit ELISA kit |
|||
| E02A0231-48 | BlueGene | 1 plate of 48 wells | 624 EUR |
Rat ANG1-9Â Kit ELISA kit |
|||
| E02A0231-96 | BlueGene | 1 plate of 96 wells | 822 EUR |
Pig ANG1-9Â Kit ELISA kit |
|||
| E07A0231-192T | BlueGene | 192 tests | 1524 EUR |
Pig ANG1-9Â Kit ELISA kit |
|||
| E07A0231-48 | BlueGene | 1 plate of 48 wells | 624 EUR |
Pig ANG1-9Â Kit ELISA kit |
|||
| E07A0231-96 | BlueGene | 1 plate of 96 wells | 822 EUR |
Dog ANG1-9Â Kit ELISA kit |
|||
| E08A0231-192T | BlueGene | 192 tests | 1524 EUR |
Spośród 91 izolatów, 12 typów POT obejmujących 38 izolowanych szczepów MRSA uznano za nakładające się. Pięć z nich wykryto na różnych oddziałach, a pozostałych siedem na tym samym oddziale, w tym na izbie przyjęć. Trzy z siedmiu szczepów POT 93-155-111 wykryto na oddziale chirurgicznym, a wszystkie cztery szczepy POT 93-157-61 wykryto na oddziale kardiochirurgicznym. Dane te sugerują, że przeniesienie szczepów MRSA z tymi samymi typami POT z tych samych oddziałów miało charakter szpitalny oraz że POT dokładnie i szybko identyfikował szczepy MRSA, co pozwalało na skuteczną kontrolę infekcji i przenoszenia.